Игроки управляют Джаксом, выжившим в постапокалиптическом мире научного фэнтези. Elex 2 — это ролевая игра с видом от третьего лица. Игроки могут присоединиться к шести фракциям, каждая из которых представляет свою философию. Вещество элекс, пришедшее из космоса, наделяет людей способностями, эквивалентными магии, и различные фракции предпочитают либо магию, либо технологии. В бою используется система, в которой такие действия, как атака или защита, истощают выносливость Джакса. Без достаточной выносливости Джакс не сможет атаковать или защищаться. Джакс оснащен реактивным ранцем, с помощью которого игроки могут исследовать открытый мир. Повышение уровня позволяет Джаксу улучшить свои характеристики, что позволяет ему использовать лучшее снаряжение. Антагонисты — техноорганические пришельцы, против которых Джакс должен объединить различные фракции.